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樹(shù)立成功的細(xì)胞培養(yǎng)空間

人體內(nèi)有超過(guò)一萬(wàn)億個(gè)細(xì)胞。這些整潔的包裹在精致的同步劃分,差異化,變形和伸展,毆打和伸展方面進(jìn)行協(xié)作。就像類似于魔幻現(xiàn)實(shí)主義的東西一樣,這些獨(dú)立生活的微小構(gòu)件疊在一起,讓位于一個(gè)難以想象的復(fù)雜機(jī)器:人體。然而,每個(gè)細(xì)胞內(nèi)部都是一個(gè)巨大的宇宙,核心太陽(yáng)位于其中心。

一百多年來(lái),科學(xué)家們一直試圖窺探這些細(xì)胞,哄騙保護(hù)良好的秘密,挖掘產(chǎn)生生命(和死亡)的機(jī)制。但是,如果細(xì)胞附著在體內(nèi)器官上,怎么能理解細(xì)胞呢?

細(xì)胞培養(yǎng)以組織培養(yǎng)開(kāi)始。科學(xué)家們砍掉了一些動(dòng)物和一些器官,并試著在盤子里養(yǎng)了幾天。**早的組織培養(yǎng)物由漂浮在溫鹽水中的雞胚組成。這項(xiàng)技術(shù)是由一位名叫Wilhelm Roux的胚胎學(xué)家在19世紀(jì)后期開(kāi)創(chuàng)的。其他人很快效仿。20世紀(jì)帶來(lái)了一系列進(jìn)步,**終使得細(xì)胞而不是組織被分離并保持在營(yíng)養(yǎng)湯中。20世紀(jì)40年代帶來(lái)了**個(gè)小鼠淋巴細(xì)胞系; 20世紀(jì)50年代帶來(lái)了鷹的著名媒體配方以及現(xiàn)在備受爭(zhēng)議的HeLa系列的建立。

今天,基本原則保持不變,但技術(shù)以極快的速度發(fā)展。細(xì)胞現(xiàn)在無(wú)限期地存在于孵化器內(nèi)。干細(xì)胞轉(zhuǎn)化為心肌細(xì)胞,這些心肌細(xì)胞在板塊中敲打,或者是具有長(zhǎng)而纏繞的軸突卷須的神經(jīng)元。成纖維細(xì)胞被重編程為干細(xì)胞。忘了兩個(gè)維度!癌細(xì)胞以三維(或四個(gè),如果你加入時(shí)間成分)生長(zhǎng),模仿體內(nèi)的腫瘤??茖W(xué)家越來(lái)越接近治療前沿,進(jìn)展是驚人的。

Lee Ligon是倫斯勒理工學(xué)院生物科學(xué)系的副教授和副主任。她與細(xì)胞一起工作了將近25年,并記得她早年在替補(bǔ)席上引起的興奮細(xì)胞培養(yǎng)。“我**次看到熒光線粒體在軸突和樹(shù)突中移動(dòng) - 現(xiàn)在聽(tīng)起來(lái)很溫和,但當(dāng)時(shí),它真是令人敬畏!”

Lee Lignon的實(shí)驗(yàn)室

Lee Ligon實(shí)驗(yàn)室的成員

如今,她的實(shí)驗(yàn)室致力于制作仿生組織培養(yǎng)模型,特別是腫瘤微環(huán)境模型。“我們已經(jīng)開(kāi)發(fā)出共培養(yǎng)多種細(xì)胞類型的方法,使用具有不同機(jī)械性質(zhì)的不同3D ECM(細(xì)胞外基質(zhì))模型,以及這些特征的各種組合。我們現(xiàn)在正致力于開(kāi)發(fā)一種高通量的通量方法來(lái)研究腫瘤微環(huán)境的生物力學(xué)特性。“

更復(fù)雜的設(shè)置,同樣的老壞蛋

然而,盡管取得了無(wú)數(shù)進(jìn)展,但仍有老敵人困擾著實(shí)驗(yàn)并阻礙了調(diào)查結(jié)果。這些是微生物破壞者,大膽地在細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中建立了商店。這些是訓(xùn)練有素的工作人員,他們沒(méi)有完全掌握無(wú)菌技術(shù),偷工減料或忽視協(xié)議。根據(jù)科學(xué)家和**的說(shuō)法,這些是新研究人員想要獲得成功和競(jìng)爭(zhēng)力所需要的東西。

然而,盡管取得了無(wú)數(shù)進(jìn)展,但仍有老敵人困擾著實(shí)驗(yàn)并阻礙了調(diào)查結(jié)果。

韋恩州立大學(xué)藥理學(xué)副教授索科爾托迪強(qiáng)調(diào),正確培訓(xùn)員工**關(guān)重要:“污染始終是一個(gè)問(wèn)題,永遠(yuǎn)是一個(gè)問(wèn)題。你可以擁有所有的花里胡哨,但是一旦你將人類引入等式,你就會(huì)遇到問(wèn)題。自己培訓(xùn)你的員工,如果你不熟悉細(xì)胞培養(yǎng),請(qǐng)確保找到有經(jīng)驗(yàn)的人或在線期刊并向他們學(xué)習(xí)。“考慮閱讀Geraghty RJ等人的文章,開(kāi)始學(xué)習(xí)。1

同時(shí)要注意令人驚訝的污染源。例如,熒光燈可以光活化HEPES緩沖液,核黃素和色氨酸,從而產(chǎn)生過(guò)氧化氫和自由基。血清補(bǔ)充劑是生物和化學(xué)污染的常見(jiàn)來(lái)源。出于這個(gè)原因,**好堅(jiān)持使用過(guò)去成功的特定來(lái)源和大量血清。

偽裝成乳腺癌的黑色素瘤 - 為什么細(xì)胞系驗(yàn)證是優(yōu)先考慮的問(wèn)題

迄今為止,有488個(gè)細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤識(shí)別。記錄這些細(xì)胞的數(shù)據(jù)庫(kù)由G際細(xì)胞系認(rèn)證委員會(huì)維護(hù)。

其中**臭名昭著的是MDA-435(或MDA-MB-435)系列。這些細(xì)胞于1975年在實(shí)驗(yàn)室研究中出現(xiàn)。從那時(shí)起,這些細(xì)胞出現(xiàn)在超過(guò)一千篇科學(xué)論文中,如乳腺癌細(xì)胞。然而,事實(shí)證明這是一個(gè)大問(wèn)題。當(dāng)科學(xué)家檢查這些細(xì)胞的DNA時(shí),他們驚呆了,發(fā)現(xiàn)MDA-435是黑素瘤系,而不是乳腺癌系。

期刊現(xiàn)在要求或強(qiáng)烈鼓勵(lì)科學(xué)家驗(yàn)證他們的細(xì)胞系。2015年的自然評(píng)論呼吁科學(xué)家在這方面更積極主動(dòng),但承認(rèn)共同的障礙:“如果我們排除無(wú)知和漠不關(guān)心,那么分析的成本和簡(jiǎn)單性似乎是普遍使用細(xì)胞鑒定的**大障礙。” 2

STR(短串聯(lián)重復(fù))和SNP(單核苷酸多態(tài)性)分析代表了驗(yàn)證細(xì)胞系同一性的可行方法。STR涉及分析遍布基因組的重復(fù)序列元素,長(zhǎng)度為3-7個(gè)堿基對(duì)。SNP是同一物種成員之間的遺傳變異,在特定基因座內(nèi)是保守的,可用于確認(rèn)同一性。可以獲得用于SNP評(píng)估的商業(yè)試劑盒,而科學(xué)家可以將細(xì)胞發(fā)送到Promega或ATCC等公司進(jìn)行STR分析。

非營(yíng)利組織ATCC聲稱所有細(xì)胞系都在其網(wǎng)站上經(jīng)過(guò)STR驗(yàn)證。此外,ATCC還推出了一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),科學(xué)家可以使用該數(shù)據(jù)庫(kù)將其結(jié)果與記錄的人類細(xì)胞系的概況進(jìn)行比較。

分析也有局限性。雖然這些方法可用于建立同一性,但它們不評(píng)估細(xì)胞純度,即不存在種間交叉污染或污染物,例如病毒和微生物,表型,形態(tài)或細(xì)胞倍性。

康寧科學(xué)培訓(xùn)和教育經(jīng)理Mark Rothenberg博士警告說(shuō),應(yīng)該建立強(qiáng)有力的支原體檢測(cè)計(jì)劃。“支原體可以在引擎蓋中的一滴液體中保持活6-8天,并且很容易污染整個(gè)設(shè)施,”他解釋道。此外,雖然它與大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室建立的協(xié)議背道而馳,但他表示,除非建立原始培養(yǎng)物,否則應(yīng)考慮在培養(yǎng)基中不使用抗生素。“抗生素可以隱藏細(xì)菌的存在并增加污染其他培養(yǎng)物的風(fēng)險(xiǎn)。”他強(qiáng)烈推薦康寧撰寫的關(guān)于如何管理污染的參考文章。3

遏制污染 - 使用技術(shù)和常識(shí)

無(wú)論空間或技術(shù)的復(fù)雜程度如何,良好的老常識(shí)都可以走很長(zhǎng)的路。**銷售代表Brian Langenderfer與DAI Scientific合作了22年。他說(shuō),他看到的**大錯(cuò)誤之一就是在人流量高的交通區(qū)域建立了細(xì)胞培養(yǎng)空間。

Natalie Swartz是位于底特律的SmithGroupJJR的實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)師,他與大學(xué)和科學(xué)家合作設(shè)計(jì)符合他們需求的空間:“我們?cè)噲D設(shè)計(jì)靈活性; 這是我們**終看到的**大創(chuàng)新。“靈活性意味著高度可調(diào)的輪子上的長(zhǎng)凳。人體工程學(xué)內(nèi)置于這些模塊化組件中,因此科學(xué)家可以根據(jù)任務(wù)站立或坐著。

在可能的情況下,她建議研究人員專注于“三角形設(shè)計(jì)”,這意味著生物安全柜,冰箱和培養(yǎng)箱在戰(zhàn)略上和附近安裝,同時(shí)采取一定的預(yù)防措施。例如,“流動(dòng)罩不應(yīng)相互設(shè)置,因?yàn)闅饬鲿?huì)污染樣品,”她說(shuō)。“同樣,您需要距離生物安全柜三到四英尺的設(shè)備,這樣您就可以安全地取出樣品。”

羅滕伯格補(bǔ)充說(shuō),“孵化器應(yīng)放置在重型設(shè)備和電梯振動(dòng)可能性**小的地方。”

所有**都提到,在建立細(xì)胞培養(yǎng)空間時(shí),您應(yīng)該考慮在生物安全柜中使用哪些用品。您應(yīng)該能夠在不離開(kāi)座位的情況下到達(dá)大部分物品。你打擾細(xì)胞周圍空氣的次數(shù)越少越好。

根據(jù)Swartz的說(shuō)法,大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室都是在20世紀(jì)70年代設(shè)計(jì)的,然后在21世紀(jì)初進(jìn)行了改造。通常,較舊的實(shí)驗(yàn)室的設(shè)備與冰箱,培養(yǎng)箱和不同房間的引擎蓋分開(kāi)。但是所有這些運(yùn)輸都不好,并提供了無(wú)數(shù)的機(jī)會(huì)來(lái)妥協(xié)無(wú)菌空間。

如果您是在較老的空間中使用有限資源的眾多科學(xué)家之一,您可以采取許多步驟來(lái)設(shè)計(jì)成功的細(xì)胞培養(yǎng)空間。

Swartz建議您在設(shè)置工作空間時(shí)考慮三個(gè)主要方面:組織,合并和上述三角形配置。“shou先,組織空間。嘗試通過(guò)任務(wù)合并您將要使用的所有內(nèi)容。您可以創(chuàng)建任務(wù)區(qū)域,其中您需要的所有材料都在一個(gè)位置。使用輪子將物品移到生物安全柜,“她解釋道。此外,只要有可能,您應(yīng)遵循NIH指南。4

..在設(shè)置工作空間時(shí)考慮三個(gè)主要方面:組織,合并和......三角形配置。

Rothenberg回應(yīng)Swartz,并解釋說(shuō)您可以在設(shè)施的范圍內(nèi)工作。有些事情無(wú)法避免。例如,如果有窗戶,請(qǐng)確保它們已密封。

創(chuàng)新與使用它的人一樣好

使用適當(dāng)?shù)脑O(shè)備也可以預(yù)防一些細(xì)胞培養(yǎng)事故。Langenderfer認(rèn)為,如果使用得當(dāng),具有某些功能的技術(shù)可以防止很多麻煩??紤]超純凈去離子水的情況; 僅僅因?yàn)樗浅8蓛舨⒉灰馕吨鼞?yīng)該用于每一項(xiàng)任務(wù)。“多年來(lái),實(shí)驗(yàn)室一直在孵化器中使用去離子水,這是不推薦的,因?yàn)樗畷?huì)從金屬中吸收離子,并且隨著時(shí)間的推移會(huì)在內(nèi)部產(chǎn)生銹斑,”他警告說(shuō)。

“在引擎蓋上[事情的一面],如果實(shí)驗(yàn)室人員使用紫外線燈替代良好的無(wú)菌技術(shù),那么我們作為[銷售]代表,無(wú)法控制這一點(diǎn)。然而,有一些功能,如紫外線計(jì)時(shí)器和一體式不銹鋼內(nèi)飾,有助于使清潔過(guò)程更快更容易,“Langenderfer說(shuō)。

他繼續(xù)說(shuō)道,“有些孵化器沒(méi)有好的控制器,因此如果實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員打開(kāi)門或忘記更換濕度盤中的水,可能不會(huì)發(fā)出警報(bào)。實(shí)驗(yàn)室中發(fā)生的大多數(shù)事故都與研究人員對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程的實(shí)驗(yàn)技術(shù)培訓(xùn)有關(guān)。我們對(duì)所有設(shè)備進(jìn)行所有免費(fèi)在職培訓(xùn)。我們還介紹了所有控制器的正確使用和設(shè)置。在大多數(shù)情況下,是的,如果實(shí)驗(yàn)室人員正確使用和維護(hù)設(shè)備,設(shè)備就很棒。“

較新的設(shè)備考慮到了科學(xué)家們的艱辛和艱苦的**。功能包括警報(bào),可調(diào)節(jié)的高度和椅子,引擎蓋和長(zhǎng)凳的輪子,以及改進(jìn)的抗菌表面。雖然整篇文章都可以寫在上面,但Swartz和Langenderfer都強(qiáng)調(diào)了盡可能利用節(jié)能設(shè)備的重要性。如果您的部分補(bǔ)助金專門用于運(yùn)營(yíng)成本,那么這**是您需要考慮的事項(xiàng)。從長(zhǎng)遠(yuǎn)來(lái)看,你免費(fèi)繼承的舊孵化器或引擎蓋可能不值得。做你的腿部工作; “不要只購(gòu)買顧問(wèn)所擁有的同樣的老式孵化器,”Ligon說(shuō)。

Swartz警告說(shuō),一個(gè)通風(fēng)櫥消耗的能量與每天3.5個(gè)家庭一樣多,這是一個(gè)巨大的數(shù)額。盡可能在恒定容積罩上選擇可變風(fēng)罩。此外,“盡可能降低窗扇,”她建議道。“如果你使用較低的窗扇或低流速罩,你可以節(jié)省高達(dá)40%的運(yùn)營(yíng)預(yù)算。”

Langenderfer提供了一些分離建議:“在建立細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)室或任何研究實(shí)驗(yàn)室時(shí),不要只購(gòu)買目錄中的主要設(shè)備; 聯(lián)系設(shè)備**。**終,這將節(jié)省您的時(shí)間和寶貴的研究資金,并為您提供與您的研究應(yīng)用相匹配的精確設(shè)備。“

參考

1.Geraghty,RJ等人,“生物醫(yī)學(xué)研究中使用細(xì)胞系的指南”,英G癌癥雜志,111(6),1021-1046,2014。[PMID:25117809 ] 

2. Freedman,LP等人,“再現(xiàn)性:改變細(xì)胞系認(rèn)證的政策和文化”,Nat Methods,12(6):493-7,2015。[PMID:26020501 ] 

3. Ryan,J,  理解和管理細(xì)胞培養(yǎng)污染,技術(shù)公報(bào),康寧生命科學(xué)。 

4. NIH設(shè)計(jì)政策和指南,研究設(shè)施辦公室。 

圖片:Shutterstock Images和Lee Ligon的實(shí)驗(yàn)室